Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms