Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mier3Q3UHF3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mier3Q3UHF3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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