Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms