Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pid1Q3UBG2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms