Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Gtpbp6Q3U6U5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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Gtpbp6Q3U6U5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp6Q3U6U5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp6Q3U6U5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp6Q3U6U5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp6Q3U6U5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp6Q3U6U5 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Gtpbp6Q3U6U5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms