Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q3U595 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q3U595 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q3U595 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q3U595 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q3U595 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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