Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VwceQ3U515 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms