Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl21Q3U410 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms