Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms