Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Palb2Q3U0P1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms