Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms