Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms