Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms