Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms