Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms