Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms