Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms