Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp444Q3TDV8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp444Q3TDV8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms