Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stt3bQ3TDQ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms