Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem248Q3TBN1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms