Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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