Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms