Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm1Q2TV84 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms