Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms