Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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