Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

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Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms