Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms