Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms