Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms