Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms