Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pglyrp4Q0VB07 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms