Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms