Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps8Q0P5W1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms