Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms