Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms