Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col17a1Q07563 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms