Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nfe2Q07279 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms