Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms