Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bp2Q06649 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms