Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cab39Q06138 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cab39Q06138 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms