Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnal1Q05A62 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnal1Q05A62 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms