Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms