Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Thbs3Q05895 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Thbs3Q05895 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Thbs3Q05895 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs3Q05895 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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