Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a1Q05722 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms