Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms