Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms