Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emx1Q04742 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms