Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd1Q04519 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smpd1Q04519 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms