Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms