Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms